Регистрация
Ukrainian Biodiversity Information Network
Національна мережа інформації з біорізноманіття

Помощь

  1. Регистрация
  2. Вход
  3. Галерея
  4. Изображения
  5. Мои Проекты
  6. Экспортировать данные
  7. Операции с изображениями
  8. Определения
  9. Комментарии
  10. Групповое редактирование
  11. Просмотр данных
  12. Страница Распространение
  13. Использование данных в исследованиях

Здравствуйте! Только начинаете знакомство с проектом UkrBIN и не знаете, как присоединиться к нашему сообществу? Ознакомьтесь с разделом С чего начать. Если вы не нашли ответ на свой вопрос в этом разделе, тогда напишите нам на ukrbin.info@gmail.com или оставьте ваш вопрос в группе UkrBIN, а также на форуме UkrBIN.




Часто возникающие вопросы

  1. Что такое UkrBIN?
  2. Как зарегистрироваться на сайте?
  3. Как загрузить фотонаблюдения?
  4. Как добавить определение?
  5. Как добавить комментарий?
  6. Как посмотреть общее число и список зарегистрированных видов по региону?
  7. Как получить данные с сайта UkrBIN.com?
  8. Что такое IPT?




С чего начать?


Регистрация


Регистрация позволяет Вам не только просматривать информацию на сайте, но и присоединиться к накоплению и повышению качества данных о биоразнообразии, а также поделиться своими знаниями с другими. Кроме того, Вы имеете возможность скачивать массивы первичных данных для дальнейших исследований.




Вход


Введите логин и пароль

Галерея


С главного меню перейдите в Просмотр данных > Галерея. Выберете необходимый макротаксон (Животные, Растения... и т.д.) нажав на изображение или быстро перейдите к необходимому виду через Поиск таксона - в правом верхнем углу страницы. Со страницы галерея доступны просмотр последних наблюдений (Последние добавления) и Последние комментарии к наблюдениям (нажмите еще... , чтобы просмотреть все)

Предварительный просмотр. Увеличение изображения


Нажмите в верхнем левом углу, чтобы быстро просмотреть увеличенное изображение


Просмотр по списку видов


Нажмите [species] чтобы перейти к просмотру по списку видов, минуя промежуточные таксоны между семейством и видом

Просмотр по систематике


Нажмите [systematic] чтобы перейти к просмотру по систематике


Сравнить изображения


Нажмите , чтобы перейти в режим сравнения изображений (1). Введите название таксона и найдите его через Поиск таксона (2). Выберете фото для сравнения (3)


Изображения


Изображения, которые поступают в базу данных являются фотодокументами, подтверждающими присутствие видов в данной местности, или находок ископаемых видов.

  • Фотографии должны быть достаточно качественными, чтобы можно было распознать вид.
  • Изображения должны содержать:
    • Географическое место и координаты.
    • Дату.
    • Местообитание (биотоп).

    Рекомендации: Во время съемки (особенно мелких позвоночных) к объекту желательно прикладывать линейку для масштаба. Это способствует точному определению. Координаты места наблюдения.


  • Допустимы изображения экземпляров из биологических коллекций, живых и погибших организмов, следов животных и следов их жизнедеятельности.
  • Избегайте загрузки изображений:
    • Культурных растений и домашних животных в неволе.
    • Домашних животных, которые случайно сбежали (за искючением одичавших, которые формируют устойчивые природные популяции).
    • Лабораторных линий животных и растений.
    • Диких животных и растений, которые содержат/выращивают в искусственных условиях (за исключением особей, которые были выловлены/собраны и для которых указаны оригинальное место происхождение и дата вылова/сбора).
    • Которые отображают жестокое обращение с животными, сцены убийства и охоты.

    Загрузка изображений

    Подготовка фотографий к загрузке

    1. Удостоверьтесь, что изображение в фокусе
    2. Обрежьте лишние поля вокруг объєкта, если они слишком большие
    3. Длинная сторона фотографии не более 1200 пикселей


    Использование функции Crop на примере программы FastStone


    Этапы загрузки


    Нажмите иконку "Загрузить фото" с главного меню, или выберете из субменю "Мой UkrBIN"



    Выберете фото и заполните форму

    1. Выберете файлы с устройства
    2. Выберете: Страну, Провинцию (Штат), Район (Округ), название локалитета наблюдения
    3. Введите координаты с помощью инструмента Карта... (3а) или вручную, в десятичном [36.989213, 84.231474], или стандартном формате [36°59'21.2"N 84°13'53.3"E].
      Координаты можно определить с помощью GPS устройства, мобильного GPS приложения, например, Handy GPS,
      и веб приложения Google Maps (см. также инструкцию ниже)
    4. Выберете дату вручную или автоматически, нажав "Использовать дату из EXIF"
    5. Выберете название, если известно, с помощью поля Поиск таксона. Если не знаете, укажите название царства в верхнем поле: "Животные", "Растения" и т.д.
    6. Нажмите "Загрузить"


    Дата

    Вы можете внести дату отдельно, с помощью календаря.

    Как внести дату с помощью календаря?

    Дата воспринимается системой только когда она внесена в соответствующем формате "дата". Для предупреждения ошибок в дате мы используем встроенный календарь.


    Координаты


    Как внести координаты при загрузке фото


    Как внести координаты после загрузки фото



    Меню > Просмотр данных > Карты




    Внести координаты можно также в режиме редактирования фото

    Выберете фото для редактирования

    Нажмите иконку "Редактировать"


    Если известно, внесите координаты в соответствующие поля формы редактирования

    Найдите координаты с помощью веб приложения Google Maps , если они не известны, но Вы знаете, где именно сделали наблюдение.





    Редактировать изображения


    Иногда возникает необходимость перезагрузить (перезаписать) фотографию, которая была загружена ошибочно. Например, нужно обрезать лишние поля, развернуть фото, или загрузить другое фото вместо существующего.

    1. Подготовьте изображение (на Вашем устройстве), которым Вы хотите заменить старое изображение

    2. Нажмите иконку "Отредактировать изображение", которая расположена под фотографией

    3. Нажмите кнопку и выберете новое фото с Вашего устройства

    4. Нажмите кнопку




    Мои Проекты


    Это система для записи собственных наблюдений без фотодокументирования. Каждый пользователь может начать вносить свои текущие и прошлые наблюдения (из полевых дневников, лабораторных журналов, коллекций) через форму (отдельными записями) или загрузить заранее подготовленный CSV-файл з данными про наблюдения.
    Система имеет двухуровневую структуру.


    Проект1 >

    Список1

    Список2

    ...

    Проект2 >

    Список1

    Список2

    ...



    Каждый проект может содержать один или несколько списков.
    Название проектов и списков можно редактировать.
    В каждый список вносятся отдельные записи наблюдения или массив записей в
    CSV файле


    Меню > Мой UkrBIN > Мои Проекты >




    Создать проект


    Создать список

    Сейчас ваш список пуст. Нужно заполнить его данными (отдельными записями или массивом в CSV файле).

    Внести отдельную запись в список
    Чтобы внести запись, нажмите линк Добавить запись,



    заповніть форму и нажмите кнопку . Ваша запись сохранена! Чтобы проверить результат, перейдите на страницу соответствующего списка или вида и откройте вкладку Наблюдения или Карта.



    Стандарты и подготовка данных в CSV файле (Загрузить образец таблицы)



    Поля таблицы:


    Key4

    ID from source database. ID (уникальный номер) записи из оригинальной базы данных [Не может быть пустым]

    Key

    Taxon name. Латинское название вида [Не может быть пустым]

    Country

    Country name. Название страны [Не может быть пустым]

    State

    Primary administrative division: Province, State etc. Название административной единицы первого порядка (область, штат) [Не может быть пустым]

    County

    Secondary administrative division: County, District etc. Название административной единицы второго порядка (район, округ)

    GLocality

    Primary Location field. Название локалитета (поле 1)

    SLocality

    Secondary Location field. Название локалитета (поле 2)

    Date

    Start date of sampling. Дата начала сбора или наблюдения. Формат данных: Дата

    DateTo

    End of sampling date, date for time spans (e.g. long-term traps, monitoring data etc.). Дата конца сбора или наблюдения. Формат данных: Дата

    Collectors

    Name(s) of collector(s)/observer(s). Use "Anonymous" if not available. Имя сборщика (сборщицы). Используйте "Anonymous", если имя неизвестно

    Host

    Host plant for phytophagous species or Host for parasitic speces, epiphytes etc. Название кормового растения, хозяина, жертвы

    Method

    Collecting/observation method. Метод сбора (наблюдения)

    Ecology

    Habitat description. Тип биотопа

    LatDeg

    Latitude. Широта в десятичном формате (например: 50.1239). Целое число отделяется ТОЧКОЙ! [Не может быть пустым]

    LongDeg

    Longitude. Долгота в десятичном формате (например: 36.2575). Целое число отделяется ТОЧКОЙ! [Не может быть пустым]

    ElevationM

    Elevation in meters. Высота в метрах

    Specimens

    Number of unsexed specimens. Количество особей, для которых пол не установлен или не применим (бесполые или гермафродиты)

    Males

    Number of males. Количество самцов

    Females

    Number of females. Количество самок

    Type

    type specimen category: Holotype, Lectotype, etc. Категория типового экземпляра Holotype, Paratype, Lectotype, Paralectotype, Syntype

    Notes

    Extra field for Notes. Поле для заметок

    Museum

    Museum abbreviature . Аббревиатура музея (список аббревиатур музеев)

    ID

    Identified by. Кто определил

    Precision

    Coordinates precision from 1 to 6: 1- GPS, 2-map/text derived coordinates, 3 - city centroid, 4- adm2 centroid 5 - adm1 centroid 6-country centroid. Точность координат по шкале 6-ти бальной шкале: 1- GPS, 2-точное место на карте/координаты восстановлены из текстовых данных этикеток, 3 - географический центр населенного пункта, 4- географический центр административной единицы второго порядка (района), 5 - географический центр административной единицы первого порядка (область, штат), 6 - географический центр страны [Не может быть пустым]

    Reference

    Literature source reference. Литературный источник (Автор, рік)

    Reference

    Extra field 2. Дополнительное поле




    Добавить список записей CSV файлом с помощью IPT

    IPT (Integrated Publishing Toolkit) это интегрированный инструмент публикации массивов данных, который позволяет загрузить сразу неограниченное число записей из внешней базы данных в базу данных UkrBIN. Инструмент автоматически читает и верифицирует данные с загружаемой таблицы. В случае ошибок, система оповещает вас об ошибках или об отсутствии названия в дереве таксонов UkrBIN. В случае проблем с загрузкой массива данных через IPT, обратитесь за помощью по адресу ukrbin.info@gmail.com

    Чтобы перейти к загрузке массива через IPT, нажмите Импорт данных из CSV



    Удалить список в проектах



    Экспортировать данные


    Каждый зарегистрированный пользователь может получить массивы первичных данных UkrBIN о распространении видов флоры и фауны для дальнейшего анализа/исследования с обязательством выполнять Условия использования и Ссылаться на проект UkrBIN.

    В субменю Мой UkrBIN выберете Export data. Если Вам нужен весь массив данных целиком, тогда нажмите . Если Вам нужен определенный таксон, выберете название с помощью поля Поиск таксона.


    Операции с изображениями



    Как сгруппировать несколько изображений одного объекта?




    Как разгруппировать несколько связанных изображений?





    Определение


    Как добавить определение? Определять фотографии может каждый зарегистрированный пользователь. Эксперты проверяют правильность определения.
    Вы можете самостоятельно добавить определение к любым фотографиям и указать степень достоверности.


    Достоверность обозначается цветовыми тегами:

    красный (возможно)
    жевтый (скорее всего)
    зеленый (достоверно)



    Комментарии


    Комментарии помогают общаться пользователям друг с другом. Следуйте этой 3-шаговой инструкции чтобы добавить текстовый и/или фото-комментарий

    Групповое редактирование




    1. Выберете группу изображений
    2. Перейдите вниз страницы (клавиши Ctrl + End)
    3. Активируйте редактирование соответствующего параметра
    4. Отредактируйте соответствующие параметры
    5. Сохраните изменения кнопкой

    Просмотр данных

    Вкладка Просмотр данных

    Общее число наблюдений (2)

    Общее число видов и Топ рейтинг видов по наблюдениям (3)

    Наблюдатели (4)

    Определяющие (5)




    Топ статистика:
    Последние добавления: 50 недавно добавленных наблюдений
    Последние наблюдения: 50 недавних наблюдений
    Часто наблюдаемые виды: 50 наиболее часто наблюдаемых видов
    Недавно добавленные виды: 50 последних новых видов, внесенных в базу данных



    Наблюдатели
    Число видов/наблюдений по фото
    Число видов/наблюдений по записям
    Общее число видов (фото + записи)
    Всего наблюдений

    Просмотр данных > Распространение



    Страница Распространение

    У вас есть возможность быстро посмотреть общее число видов по регионам используя фильтры по географии и по таксонам. Выберете необходимый регион и таксон.




    Нажмите на соответствующее общее число видов, чтобы перейти непосредственно к списку



    Список видов





    Использование данных в исследованиях


    GIS анализ
    Предлагаем ознакомиться с проектами
    ГИС-Натуралист
    BIODIVERSITY INFORMATICS TRAINING CURRICULUM
    Курсы по использованию программы QGIS в анализе первичных данных по биоразнообразию ведёт
    Антон Биатов на базе проекта ГИС-Натуралист.

    Range-diversity plot анализ
    https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371%2Fjournal.pone.0019359&fbclid=IwAR1Vz5UXwdkFTZCojr7R4jXWVngZFEVFfUiKEGZgDkqSgKrzgMpSGsd060I

    Assemblage Dispersion Fields анализ
    https://www.pnas.org/content/pnas/102/22/7871.full.pdf

    Range-diversity plot аналіз у природоохороній галузі. Оцінка впливу на довкілля (ОВД)
    https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0006320712004223

10.08.2019 16:04:02   Nikolai Yunakov
Online: Zhakov · Martynov Alexander and 38 unregistered users

BugGallery v.1.4   © UkrBIN.   PHP v. 7.2.19-0ubuntu0.18.04.2,   MySQL v. 5.7.27-0ubuntu0.18.04.1-log (mysqli).